الاتحاد هو مظلة علمائية جامعة تضم نخبة من علماء الأمة الإسلامية، يهدف إلى تقديم مواقف موضوعية ومتوازنة تجاه القضايا العالمية والمستجدات التي تهم الأمة. يتميز هذا الاتحاد بتنوع تكوينه العلمائي، حيث يشمل مختلف المدارس الفكرية والمذهبية في الإسلام، مما يجعله مرجعية معتمدة وموثوقة للمسلمين في شتى أنحاء العالم.
يحرص الاتحاد على الحفاظ على استقلاليته ونزاهته، متجنباً الانحيازات والتعصب، سواء كان ذلك على أساس عرقي، إقليمي، أو مذهبي. يعمل على تعزيز مبادئ السلم والتفاهم والوفاق، ويضع في أولوياته الدعوة إلى إصلاح ذات البين وحل النزاعات بالحسنى.
تتلخص رسالة الاتحاد في بناء جسور الحوار والتعاون بين المسلمين وغيرهم، مع الحرص على المشاركة الفعّالة في الشأن الإنساني العام. يسعى الاتحاد إلى تأييد حقوق الشعوب في التعبير والإصلاح والنهوض، داخل إطار يحفظ المصالح العامة ويعزز السلم الأهلي.